Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC90BQ9GZT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms