Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A8Q9C0K1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A8Q9C0K1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC39A8Q9C0K1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms