Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms