Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2OQ9C0C9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms