Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM31Q9BZY9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM31Q9BZY9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms