Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXP3Q9BZS1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms