Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CELF4Q9BZC1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CELF4Q9BZC1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CELF4Q9BZC1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms