Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFIH1Q9BYX4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms