Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SYCP2Q9BX26 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SYCP2Q9BX26 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms