Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP4Q9BWG4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP4Q9BWG4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms