Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
YIPF4Q9BSR8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
YIPF4Q9BSR8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms