Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms