Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GINS3Q9BRX5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GINS3Q9BRX5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms