Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF25Q9BQ70 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms