Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM7Q9BQ49 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms