Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPS8Q99627 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS8Q99627 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS8Q99627 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms