Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL13Q99616 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms