Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT12Q99456 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms