Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRAMP1Q96RY5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRAMP1Q96RY5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms