Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERGIC2Q96RQ1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.6 ms