Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACCSQ96QU6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACCSQ96QU6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms