Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC115Q96NT0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms