Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RILPQ96NA2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms