Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms