Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC42Q96M95 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC42Q96M95 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms