Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL15Q96M94 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL15Q96M94 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms