Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALPK3Q96L96 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms