Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EP400Q96L91 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms