Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms