Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC136Q96JN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC136Q96JN2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC136Q96JN2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms