Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MTERF3Q96E29 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MTERF3Q96E29 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms