Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PABPC5Q96DU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC5Q96DU9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms