Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM3DQ96BQ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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FAM3DQ96BQ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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FAM3DQ96BQ1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM3DQ96BQ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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