Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NKD1Q969G9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms