Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF25Q93038 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms