Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRN2Q92932 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2Q92932 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms