Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3S1Q92572 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3S1Q92572 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AP3S1Q92572 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3S1Q92572 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3S1Q92572 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3S1Q92572 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AP3S1Q92572 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP3S1Q92572 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms