Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG4AQ8WYN0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4AQ8WYN0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms