Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PSPC1Q8WXF1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSPC1Q8WXF1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms