Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL11Q8NHH1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL11Q8NHH1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms