Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHDC9Q8NEP7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms