Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF548Q8NEK5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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