Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00116Q8NCU8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
LINC00116Q8NCU8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LINC00116Q8NCU8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms