Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC44A5Q8NCS7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC44A5Q8NCS7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms