Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC2Q8NBF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NHLRC2Q8NBF2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms