Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA6

C15orf53, Uncharacterized protein C15orf53, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf53Q8NAA6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C15orf53Q8NAA6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C15orf53Q8NAA6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms