Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00612Q8N6U2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms