Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PROM2Q8N271 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PROM2Q8N271 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms