Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOT2Q8IXI1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOT2Q8IXI1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms