Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSIG1Q86XK7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG1Q86XK7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms